لم يقبل بابا روما قرارات المجمع المسكوني الرابع (مجمع أفسس الثاني سنة 449م) الذي عُقد من أجل النظر في التماس أوطاخي الذي كان قد نادى كما مر بنا أن السيد المسيح بعد تجسده أصبح له طبيعة واحدة (وهذا يوافق العقيدة) ولكنه انحرف فقال أن الناسوت قد تلاشى في اللاهوت بمعنى أنه صار اختلاط وامتزاج وتغيير في الاتحاد (وهذا يخالف العقيدة)
ومن أجل ذلك أوضح البابا ديسقوروس رئيس مجمع أفسس الثاني الإيمان القويم فقرر المجمع أن السيد المسيح بعد تجسده صار اتحاد اللاهوت والناسوت في طبيعة واحدة بغير اختلاط ولا امتزاج ولا تغيير ورجع أوطاخي عن فكرته وآمن بمنطوق المجمع.
ولكن بابا روما رفض هذا المنطوق واتبع أسقف القسطنطينية (فلابيانوس الذي كان قد حرم أوطاخي) معتنقاً عقيدة أخرى وهي أن السيد المسيح بعد تجسده كان له طبيعتين ومشيئتين (وهذا يخالف الإيمان القويم).
وقد قرر المجمع الآتي :

( أ ) إلغاء قرارات مجمع أفسس الثاني.
(ب) تبرئة فلابيانوس أسقف القسطنطينية.
(ج) حرم أوطاخي رغم اعترافه بقرارات المجمع النيقي.
(د) عزل ديسقوروس البابا ونفيه مدعين أنه متشيعاً لبدعة أوطاخي.

وكان عدد الحاضرين :330 أسقفاً (في رواية) و 600 أسقف في رواية أخرى وكان حاضراً البابا ديسقوروس بابا الإسكندرية الذي دافع عن الإيمان؟؟!!! (كحد قول الأقباط) دفاعاً مستميتاً ولكن إزاء حيل الآخرين ذهبت صيحاته أدراج الرياح. ولم تعترف الكنيسة القبطية بهذا المجمع ولا بقراراته.

• أما كنيسه الأقباط فتسد إحتياجاتها من تبرعات المحسنين والعطايا قائله مع الرسول( ليس لى ذهب ولا فضه ولكن الذى لى أعطيك). والكنيسه القبطيه سبب غناها هو فقرها

• وكقوله وكان من بين الهاربين البطريرك الأنطاكى أثناسيوس أن البابا قام بواجبات الضيافه ولم يشعر ضيوفنا بالضائقه التى يعانى منها الأقباط لأن الله الذى بارك فى القليل قد أشبع الكثيرين خيرات

• وقام الأقباط بإرسال المعونه الغذائيه للعربيه نتيجه لما حدث من جفاف فى العربيه بعد الغزو بسنين قليله، ولم يبخل الاقباط عن مساعده المحتاج اليهم فالمصرى الصميم والاصيل تعرفه من عطائه فلما حاقت المجاعه بالمدينه المنوره ارسل الاقباط قافله قيل ان اولها المدينه واخرها مصر

• بدء هرقل حكمه بالعدل فأظهر الاقباط له ولاء عظيما (1) فعدل مع المصريين الاقباط وكان متواضعا فنصره الله على اعدائه البيزنطيين والفرس ثم اكرمه الله بحمل خشبه الصليب

• ولكن عندما تجبر (هرقل) على الاقباط وأخطأ الى الله وفعل الفحشاء والزنى وتزوج من ابنه اخيه مرتينه وأنجب منها هرقلوناس ، غضب الله عليه ورأى الامبراطوريه التى بذل حياته فى إنشائها تنهار قبل موته


• وحرب الشيطان مع الأقباط المسيحين لا بد لها من ضحايا يسقطون فى براثن الشر فقد ضل عدد من الاساقفه الاقباط بالرغم من تحذير البابا للكنيسه القبطيه كلها ومن الذين سقطوا كورش أسقف نقيوس وبقطر أسقف الفيوم وأصبحوت ملكيين

• ومن الظاهر انه كان رجل حرب وإعتاد ان يأخذ ما يريده بالقوه وإفتقر للمقومات السياسيه فأغفل آمال الشعب فحطم بهذا علاقته مع الأقباط ، ففقد الأقباط ثقتهم باليونانيين البيزنطيين المسيحيين حكامهم فى ذلك الوقت
• وكان هناك أمرا أخر من هرقل برسم أساقفه ملكيبن فى جميع أنحاء مصر والقبض على الاساقفه الاقباط وإضطهادهم ومطارده الهاربين منهم والاستيلاء على الكنائس المصريه, وطارد وقتل الاقباط المتمسكين بإيمانهم الاصيل حتى أصبحت مصر فى حاله يرثى لها فتدهور إقتصادها ورأى المصريين أن أباطره القسطنطينيه لا عمل لهم سوى إرغام المصريين على التمذهب بمذهبهم وأصبحت حريه العقيده فكره منسيه وحريه الفكر هو وهم

• فتجاهلهم الاقباط وتركوهم يديرون البلاد بدون مساعدتهم. أما ظلمهم فقد أصبح من مقومات الحياه اليوميه للاقباط . والظالم له يوما. مهما طال الزمن والظالم الشرير سوف يأتى من أشر منه أو هو من تقارب فى شره من شر الشيطان . وسوف يحكم عليهم التاريخ بأنهم كانوا وما بقوا .

• وحرب الشيطان مع الأقباط المسيحين لا بد لها من ضحايا يسقطون فى براثن الشر فقد ضل عدد من الاساقفه الاقباط بالرغم من تحذير البابا للكنيسه القبطيه كلها ومن الذين سقطوا كورش أسقف نقيوس وبقطر أسقف الفيوم وأصبحوت ملكيين

• أما المقوقس الخائن فقد رد عليه (ص) بكتاب ومعه هديه عباره عن مأكولات وعسل ودابه وثلاثه من العبيد منهم ماريا القبطيه